肾小球滤过膜由毛细血管内皮细胞、基膜和上皮细胞构成，由系膜细胞和基质构成系膜，是肾小球肾炎基本病变最常累及的部位；免疫复合物引起肾小球肾炎有两种方式：原位免疫复合物形成和循环免疫复合物沉积于肾小球。

急性弥漫性增生性肾小球肾炎的基本病变是内皮细胞和系膜细胞大量增生，表现为大红肾或蚤咬肾；临床主要表现为急性肾炎综合征，引起少尿、血尿、水肿和高血压。

急进性肾小球肾炎双侧肾增大、苍白；肾小球内有新月体形成，新月体主要由增生的壁层上皮细胞构成；临床表现为严重的血尿、蛋白尿、迅速出现的少尿，甚至氮质血症;预后极差。

肾病综合征关键性的改变是肾小球毛细血管壁损伤，血浆蛋白滤过增加，形成大量蛋白尿。长期大量蛋白尿使血浆蛋白含量减少，形成低蛋白血症。低蛋白血症引起血液胶体渗透压降低，导致水肿、组织间液增多、血容量减少，肾小球滤过减少，醛固酮和抗利尿激素分泌增加，使水钠潴留，水肿加重。低蛋白血症刺激肝脏合成脂蛋白增多，导致高脂血症。

慢性肾小球肾炎是各型肾炎的终末阶段，可形成颗粒性固缩肾；大量肾小球纤维化和玻璃样变，其所属肾小管萎缩消失或纤维化，出现肾小球集中现象。残留肾单位代偿性肥大，肾间质纤维组织增生，并有多数淋巴细胞浸润；晚期病人表现为多尿、夜尿、低比重尿、高血压、贫血、氮质血症和尿毒症。

肾盂肾炎是由细菌引起的化脓性炎症，主要侵犯肾盂、肾间质和肾小管，分为急性和慢性。急性肾盂肾炎以上行性感染较多见，主要致病菌为大肠埃希菌；血源性感染时，首先累及肾皮质内肾小管或肾小管周围的肾间质，继而扩散到邻近组织、肾小管，蔓延至肾盂。尿路梗阻、膀胱输尿管反流和尿道黏膜损伤等是肾盂肾炎的主要发病因素。肾增大、充血，表面有大小不等的小脓肿，肾盂黏膜充血、水肿，覆盖脓性渗出物；临床表现为尿频、尿急、尿痛等尿路刺激征及全身反应和尿常规异常。

慢性肾盂肾炎表面有不规则凹陷性瘢痕，肾盂黏膜粗糙增厚，肾盂、肾盏因瘢痕收缩而变形，晚期肾小球等大量肾组织破坏，可引起氮质血症和尿毒症。

肾细胞癌是肾小管上皮细胞的恶性肿瘤，多位于肾上极，表现为多彩特征，组织学分为透明细胞癌（最常见）、乳头状癌、嫌色细胞癌，早期可发生血道转移。 尿路与膀胱上皮肿瘤好发于膀胱侧壁和膀胱三角区输尿管开口处。无痛性血尿是最常见的症状。